När nu alliansen presenterat sin första budget så nämns ingenting om enprocentsmålet. Dock konstateras att de statliga resurserna till forskning har urholkats, vilket äventyrar kvaliteten på såväl grundforskning som forskningsutbildning. Så motiverar regeringen att man avser höja de årliga anslagen med 900 miljoner under en treårsperiod.
Därtill avskaffas den så kallade högskolemomsen, vilket enligt regeringen medför ett resurstillskott motsvarande 350 miljoner kronor per år. Exakt vilket år högskolemomsen ska avskaffas framgår dock inte, bara att det ska ske inom mandatperioden.
Detta behöver dock inte vara hela anslagshöjningen till forskningen. I budgeten står att anslagen "kan komma att höjas ytterligare" i forskningspropositionen som planeras till 2008. Om enprocentsmålet från alliansens gemensamma valmanifest ska infrias så måste forskningspropositionen innehålla nya satsningar värda drygt 2 miljarder kronor om året.